商標撤三需繳納的官費是1000元，由商標局收取，委托代理機構會收取適當的服務費。

商標撤三的流程是：申請人提交撤三申請。申請人進行舉證。商標局通知注冊人答辯，下發《《關于提供注冊商標使用證據的通知》，這時候注冊人需要在2個月內提交商標實際使用的證據。商標局進行證據審查和事實認定。如果注冊人和申請人對決定有任何異議的，都可向商標評審委員會提出《撤銷復審申請》

根據《中華人民共和國商標法》第四十九條規定，注冊商標沒有正當理由連續三年不使用的，任何單位或者個人可以向商標局申請撤銷該注冊商標。