商標侵權訴訟和商標行政訴訟的不同之處： 1、處理對象不同 商標行政訴訟是由于商標行政爭議，就是在商標管理過程中被處罰人對工商行政管理機關作出的處罰是否合法和適當而引起的爭議 商標侵權訴訟是侵權人與被侵權人之間因為商標侵權行為而引起的民事賠償爭議為對象的。 2、當事人在訴訟中地位不同 商標行政訴訟發生在行政主體和行政相對人，就是工商行政管理機關和被行政處罰人之間；前者只能是被告，且沒有反訴權，后者永遠是原告； 商標侵權的訴訟雙方是平等的民事主體，在訴訟中地位平等，同時享有對等的訴訟權利。 3、兩種訴訟的法律原則和適用程序不同 商標行政訴訟必須依據《行政訴訟法》，適行的是行政訴訟程序，行政訴訟中的訴訟不中止執行原則、復議選擇原則、有限變更原則等不適用于民事訴訟； 商標侵權訴訟則是依據《民事訴訟法》，適行的是民事訴訟程序，民事訴訟中的調解原則、處分原則也不全適用于行政訴訟。